木耳不僅營養價值豐富，而且具有良好的保健功效和藥用作用。木耳含有豐富的植物膠原成分，有巨大的吸附力，是腸胃傑出的“清道夫”，對人體有清滌胃腸和消化纖維素的作用。對誤食的難以消化的頭髮、穀殼、木渣、沙子、金屬屑等異物具有溶解與氧化作用。從事礦石開採、冶金、水泥製造、理髮、麵粉加工、棉紡毛紡等空氣汙染嚴重工種的人士，經常食用黑木耳能起到良好的保健作用。
木耳對於補鐵有很好的功效。每100克黑木耳中含鐵185毫克，它比綠葉蔬菜中含鐵量最高的菠菜高出20倍，比動物性食品中含鐵量最高的豬肝還高出約7倍，是各種葷素食品中含鐵量最多的是因其含鐵量高，可以及時為人體補充足夠的鐵質，所以木耳可做為一種天然的補血食品。
木耳還有多種藥用價值，是一種珍貴的藥材。明代著名醫藥學家李時珍在《本草綱目》中記載，木耳性甘平，主治益氣不飢等，有補氣益智，潤肺補腦，活血止血之功效。醫學研究證明：木耳還具有益氣強身、滋腎養胃、活血等功能，它能抗血凝、抗血栓、降血脂降低血黏度軟化血管使血液流動順暢，減少心血管病發生。黑木耳對膽結石、腎結石也有較好的化解功能，因為它所含的植物鹼具有促進消化道、泌尿道各種腺體分泌的特性，植物鹼能協同這些分泌物催化結石，潤滑腸道，使結石排出體外。
現代醫學研究表明，如果每人每天食用5-10克木耳，它所具有的抗血小板聚集作用與每天服用小劑量阿司匹林的功效相當，因此人們稱木耳為食品阿司匹林。阿司匹有同時，木耳具有顯著的抗凝作用，它能阻止血液中的膽固醇在血管上的沉積和凝結。由於黑木耳的抗血小板聚集和降低血凝作用，可以減少血液凝塊，防止血栓形成，對延緩中年人動脈硬化的發生發展十分有益，不僅對冠心病，對其他心腦血管疾病以及動脈硬化症也具有較好的防治和保健的作用。
