干擾素在代償期肝硬化和代償期肝功能良好的患者中可以謹慎應用。建議從小劑量開始，根據病人的耐受性逐漸增加，而對於進展期肝硬化則有肝衰竭的風險，最好用核苷（酸）類似物治療。拉米夫定治療可延緩疾病進展，減少肝衰竭和肝細胞癌的發生率，臨床療效主要見於未產生耐藥性的患者。對拉米夫定產生耐藥性的患者應及時加入阿德福韋酯聯合治療，最好改用阿德福韋酯單一治療。鑑於需要長期治療，也可以選擇耐藥性風險較低的藥物，如阿德福韋酯或恩替卡韋，或者用拉米夫定或替比夫定與阿德福韋酯聯合治療。
失代償期乙肝肝硬化患者的預後極差。干擾素要禁用。要選擇核苷（酸）類似物進行抗病毒治療，藥物選擇的原則與代償期肝硬化相同，但在失代償期患者中不首選阿德福韋酯，因為阿德福韋酯的抗病毒作用弱而緩慢，而且有潛在的腎毒性。值得強調的是，核苷（酸）類似物可迅速抑制HBV複製，但臨床上仍需3～6個月才能起效，因此，對於失代償期乙肝肝硬化患者應立即開始治療，不要因為強調HBV DNA水平高和ALT升高而延誤治療。對於一些取得療效的患者，可以推遲或避免進行肝移植。對於那些晚期肝硬化和嚴重肝衰竭的患者，除了肝移植，仍然沒有其他選擇。
值得注意的是，肝硬化患者的抗病毒治療與慢性乙型肝炎的抗病毒治療一樣重要，一旦發現病毒活躍複製，無論肝功能如何，HBVDNA水平多高都應及時進行抗病毒治療，其中核苷類似物應用時間最長，一旦應用不得自行停藥，如一旦病毒復發，肝功能反覆就自行停藥往往非常危險。因此，我們必須要有足夠的耐心和毅力，才能保證我們的治療效果，才能保證我們的健康，才能保證我們的生活質量，才能保證我們的健康。
