對焦慮症的起因，不同學派的研究者有不同的意見。這些意見並不一定是相互衝突的，而是互補的。
第一，軀體疾病或者生物功能障礙雖然不會是引起焦慮症的唯一原因，但是，在某些罕見的情況下，病人的焦慮症狀可以由軀體因素而引發，比如，甲狀腺亢進、腎上腺腫瘤。許多研究者試圖發現，是不是焦慮症患者的中樞神經系統，特別是某些神經遞質，是引發焦慮症的罪魁禍首。很多研究集中在兩個神經遞質上：去甲腎上腺素和血清素。很多研究發現病人處於焦慮狀態時，他們大腦內的去甲腎上腺素和血清素的水平急劇變化，但是未確定這些變化是焦慮症狀的原因還是結果。
第二，認知過程，或者是思維，在焦慮症狀的形成中起著極其重要的作用。研究發現，抑鬱症病人比一般人更傾向於把模稜兩可的、甚至是良性的事件解釋成危機的先兆，更傾向於認為壞事情會落到他們頭上，更傾向於認為失敗在等待著他們，更傾向於低估自己對消極事件的控制能力。
第三，在有應激事件發生的情況下，更有可能出現焦慮症。
1、遺傳因素：在焦慮症的發生中起重要作用，其血緣親屬中同病率為15%，遠高於正常居民;雙卵雙生子的同病率為2.5%，而單卵雙生子為50%。有人認為焦慮症是環境因素通過易感素質共同作用的結果，易感素質是由遺傳決定的。
2、病前性格特徵：自卑、自信心不足，膽小怕事，謹小慎微，對輕微挫折或身體不適容易緊張，焦慮或情緒波動。
3、精神因素：輕微的挫折和不滿等精神因素可為誘發因素。
4、生物學因素：焦慮反應的生理學基礎是交感和副交感神經系統活動的普遍亢進，常有腎上腺素和去甲腎上腺素的過度釋放。軀體變化的表現形式決定於患者的交感，副交感神經功能平衡的特徵。
