直腸指診
檢查者感覺到肛門無緊迫感呈鬆弛狀態。囑患者收縮肛門時，肛管括約肌收縮不明顯或完全無收縮力;如肛門有損傷史者，可捫及瘢痕，有的患者可觸及肛管的一側有收縮感，而另一側則無收縮感。並注意肛管直腸內是否有腫塊、壓痛等，手指退出肛門後觀察指套是否帶黏液及血。
內鏡檢查
觀察肛門直腸或結腸有無畸形、瘢痕、肛管皮膚及直腸黏膜有無糜爛、潰瘍，直腸黏膜有無充血、水腫、直腸息肉、直腸癌及肛管直腸癌等。
肛管直腸壓力測定
肛門失禁患者表現出肛管直腸內的壓力降低，頻率減慢或消失;肛管收縮壓下降;直腸肛管抑制反射消失。如潰瘍性結腸炎致肛門失禁患者直腸順應性明顯下降。
肛門內括約肌基礎壓(IASP)
成年國人氣囊式正常壓為80～140mmHg。肛門失禁時壓力降低，呈低張力性內肛門括約肌靜息壓。內肛門括約肌的功能在於提供了阻止稀便和腸腔內氣體在非排便狀態下從直腸、肛門外溢。
外肛門括約肌(EAS)收縮力
EAS是圍繞肛管下端的環形橫紋肌，參與維持肛管高壓帶壓力的30%左右。外肛門括約肌收縮時可使肛管關閉壓提高2～3倍，對糞便的節制起一定作用。EAS缺乏這種協調性運動時，就會出現肛門失禁。當受檢者最大強度的收縮肛門(提肛運動)時，肛管內壓增加的幅值即最大縮榨壓(maximum squeeze pressure，MPS)與肛管靜息壓(IASP)之差為肛門主動收縮壓，即代表EAS的肌收縮力。肛門失禁時EAS的肌收縮力降低。
直腸感覺測定
直腸感覺測定是將4cm×6cm大的帶有導管的球囊置入直腸，然後向球囊內注入水或空氣，正常直腸的感覺閾值是45ml±5ml，如為神經性的肛門失禁患者，其直腸感覺閾值消失。
直腸順應性
肛門失禁時直腸順應性下降。順應性是指容量與壓力之比率，即單位時間壓力容積變化(△V/△P)來表示器官對膨脹能力的適應性。方法是，插入一前端帶氣囊的導管，向氣囊內注入空氣或水，分次充盈氣囊(每次遞增l0ml，同時測其壓力，受檢者感到脹痛或便意感達到最大限度，同時記錄直腸壓力變化。肛門失禁時直腸順應性降低。直腸順應性正常值為4～9ml/mmHg 或3～7ml/cmH20。
球囊逼出試驗
用於瞭解恥骨肌和EAS的肌力及其功能。方法為把直徑2cm的塑料球送入直腸，球的下面連接一容器，逐漸向容器中增加重物，囑受檢者用力收縮肛門以阻止塑料球被拉出，直到該球被重物拉出為止。肛門失禁時承受重力輕，反映其肌力減弱。肛門直腸角變鈍(正常為銳角)。如直腸感覺遲鈍，正常容量不能引起排便反射，不能將球囊排出。此檢查既可用來判斷直腸的感覺是否正常，又可判斷肛門括約肌的功能。如肛門括約肌受損無括約功能，而球囊可自行滑出肛門，或輕微的增加腹壓後即可將球囊排出。
盆底肌電圖檢查
用直腸電和盆底肌電描記法，瞭解直腸平滑肌的電活動和盆底肌的電活動。肛門失禁病人縮榨及用力大便動作時活動均減弱。
肛管直腸內超聲檢查
通過肛管直腸內超聲可以清楚地顯示肛管直腸的各個層次，內括約肌及其周圍的組織結構，可以協助大便失禁的診斷。如觀察內括約肌是否完整，外括約肌是否有缺損，以及缺損的部位及範圍。該檢查不但可以協助診斷，而且為手術切口的選擇提供一定的依據。
排糞造影法
通過對用力排糞、提肛、靜息等動態觀察，瞭解肛門括約肌的功能。應用放射造影的方法研究和觀察排糞時的盆底肌和直腸動力活動，用150～200ml的硫酸鋇，灌入直腸後，用放射照相術，在熒光屏下動態觀察靜息狀態和排出硫酸鋇的情況。可判斷是否存在巨結腸，靜息狀態和排便時肛直腸角的大小，排便時肛管最大直徑，是否有直腸脫垂或直腸套迭存在，從而有利於功能性肛門失禁的診斷。如灌入直腸的鋇劑通過提肛可以保留，說明肛門括約肌有一定功能;如灌入直腸的鋇劑不由自主地流出，說明大便失禁。大多數時間內，肛提肌和恥骨直腸肌有靜息壓，因直腸被向前拉的結果，直腸和肛管之間有一較小的角度，稱為肛門直腸角，正常約107°，在做縮榨動作時，上述肌肉收縮更強，此角變小。肛門失禁時此角變鈍。
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