1.一般治療
便秘患者需根據便秘的嚴重程度、病因和類型，採取綜合治療，包括一般生活治療、藥物治療、生物反饋訓練和手術治療，以恢復正常排便生理功能。應重視生活治療，加強對患者的教育，採取合理的飲食習慣，如增加膳食纖維含量，增加水的攝入，以加強對結腸的刺激，養成良好的排便習慣，如晨起排便，及時隨大便排便，避免用力排便，同時應增加活動。同時，也要加強對 "三無 "人員的管理。"三無 "人員是指：無證無照人員、無證無照人員、無證無照人員。
2.藥物治療
（1）容積性瀉藥 主要包括可溶性纖維（果膠、車前草、燕麥麩等）和不溶性纖維（植物纖維、木質素等）。容積性瀉藥起效慢，副作用小，安全性高，所以對妊娠期便秘或輕度便秘比較有效，但不適合作為暫時性便秘的快速瀉藥治療。
（2）潤滑性瀉藥可潤滑腸壁，軟化糞便，使糞便易於排出，使用方便，如開塞露、礦物油或液體石蠟。
（3）鹽類瀉藥如硫酸鎂、鎂乳等，這些藥物可引起嚴重的不良反應，臨床使用應慎重。
（4）滲透性瀉藥 常用的藥物有乳果糖、山梨醇、聚乙二醇4000等。適用於糞便堵塞或作為慢性便秘者的臨時治療措施，對容積性輕瀉劑療效不佳的便秘患者，是較好的選擇。
(5) 刺激性瀉藥包括含蒽醌的植物性瀉藥（大黃、佛手瓜、番瀉葉、蘆薈）、酚酞、蓖麻油、雙醋酸鹽等。刺激性瀉藥只有在容積性瀉藥和鹽類瀉藥無效的情況下才可以使用，而且有些刺激性瀉藥的強度較大，不適合長期使用。長期應用蒽醌類瀉藥可引起結腸黑便病或瀉藥定植，造成平滑肌萎縮和腸間肌叢的損傷，反而加重便秘，停藥後可恢復。
（6）促動劑莫沙必利、伊託必利有促胃腸蠕動作用，普魯卡必利可選擇性地作用於結腸，可根據情況選用。
3.器械輔助
如果糞便在肛門口附近的直腸內變硬、滯留，或者患者年老體弱，腸道運動能力差或缺乏，可採用結腸水療或清潔灌腸。
4、生物反饋療法
可用於直腸肛門和盆底肌肉功能障礙的便秘患者，其長期療效較好。生物反饋治療可以訓練患者在排便時放鬆盆底肌肉，使排便時腹肌和盆底肌群的活動協調一致；對於排便閾值異常的患者，應重視排便反射的重建和調整排便感知的訓練。訓練項目沒有具體規範，訓練強度較大，但安全有效。對於盆底功能障礙的患者，應首選生物反饋療法而不是手術。
5.認知療法
嚴重便秘的患者往往表現出心理因素或障礙，如焦慮甚至抑鬱。
6.手術治療
對於嚴重的頑固性便秘，上述所有的治療方法都是無效的，如果便秘是結腸傳輸功能障礙，病情嚴重，可以考慮手術治療，但手術的長期效果仍有爭議，必須謹慎選擇病例。就便秘這個大群體而言，真正需要手術治療的人仍是少數。
