精確定位癲癇灶是手術取得良好治療效果的關鍵，目前尚無一種方法能夠簡單定們癲癇灶，應該根據不同患者的具體情況採取不同的多種手段進行綜合定位，一般可以利用多種不同的手段進行分級定位。
第一級：檢查CT或磁共振，常規腦電圖。
如果CT或磁共振發現有病灶，腦電圖證實癲癇發作與病灶有關，比如不發作時的腦電圖發現局部有明顯的癲癇樣放電，或發作時癲癇放電起源於一個固定的區域，與臨床症狀相吻合，則可以粗略定位癲癇灶的位置。50％-60％的患者可以在此基礎上直接手術，手術當中可以進一步利用皮層腦電圖，也就是把電極直接放在大腦表面進行紀錄，進一步確定癲癇灶的範圍。
第二級：如果CT或磁共振檢查不能發現病灶，或者所發現的病灶與腦電圖檢查以及臨床發作表現不致，則應該進行其他輔助檢查，例如，檢查正電子斷層掃描等同位素檢查，有時也會根據情況選擇磁共振波譜分析，這些檢查可以輔助幫助定位，如果這些檢查結果仍然不能確定癲癇灶的位置，那麼我們就要進行有創傷性的侵入性檢查。
第三級：上述全部檢查結果仍然不能定位者，需要接受顱內電極腦電圖檢查，也就是在手術室接受手術，將電極放在大腦的表面或者大腦的內部縫合固定好，患者回到病房後繼續接受顱內電極的腦電圖檢查，通常會連續記錄幾天的時間，記錄到數次癲癇發作時的腦電圖，根據顱內電極腦電圖的結果進行癲癇灶定位。
