根據病因，失眠可分為原發性和繼發性兩類。
1原發性失眠通常缺乏明確的病因，或在排除了可能的失眠原因後仍然存在，主要包括心理生理性失眠、特發性失眠和主觀性失眠3種類型。原發性失眠的診斷缺乏具體指標，主要為排除性診斷。當失眠的可能原因被排除或治癒後，仍遺留有失眠症狀，可考慮原發性失眠。臨床上發現，心理生理性失眠的病因可追溯到某一特定或長期事件對患者大腦邊緣系統功能穩定性的影響，邊緣系統功能穩定性的失衡最終導致大腦睡眠功能的紊亂，而發生失眠。
2 繼發性失眠包括因身體疾病、精神障礙、藥物濫用引起的失眠，以及與睡眠呼吸障礙、睡眠運動障礙相關的失眠，等等。近年來提出了合併失眠的概念，以描述伴隨其他疾病的失眠，因為失眠常常與其他疾病同時發生，有時很難確定這些疾病與失眠之間的因果關係。
