1、咽鼓管功能障礙一般認為此為本病的基本病因。兒童腺樣體肥大、扁桃體肥大、鼻炎、鼻竇炎、鼻咽部腫瘤或淋巴組織增生等均可直接堵塞咽鼓管咽口，影響咽鼓管咽口的開放。同時，兒童負責咽鼓管開放的肌肉發育尚不成熟，收縮乏力，從而影響咽鼓管的正常開放。加之小兒咽鼓管的軟骨支架彈性較差，咽鼓管鬆軟，當鼓室處於負壓狀態時，咽鼓管管壁易發生塌陷，嚴重影響其通氣功能。當咽鼓管堵塞或功能障礙時可以導致分泌性中耳炎的發生。
2、感染是分泌性中耳炎的又一致病因素。兒童咽鼓管短而寬，近於水平位，因此鼻咽部的感染易擴散至中耳，這也是兒童發好分泌性中耳炎的結構基礎，也是患感冒或其它上呼吸道感染、平臥位餵奶的兒童患分泌性中耳炎的可能更大的原因。
3、免疫反應在分泌性中耳炎中也扮演重要角色。中耳為一獨立的免疫防禦系統，隨小兒年齡的增長逐漸發育成熟。兒童的免疫系統尚未成熟，容易發生分泌性中耳炎。
由於兒童主訴不清，在小兒聽力受到影響時家長才發現就診，常常延誤診斷和治療。分泌性中耳炎可造成兒童的聽力損失，影響言語語言發育，應高度警惕和及時觀察治療。
