1)沙門氏菌屬：是細菌性食物中毒最常見的病原菌之一。革蘭氏染色陰性，其中以鼠傷寒、豬霍亂、腸類沙門氏菌較常見。沙門氏菌主要存在於家畜、家禽及鼠類體內。該菌對外界抵抗力較強，在水、乳類及肉類食品中，能生存幾個月。
(2)嗜鹽菌(副溶血性弧菌)：是多形態桿菌，革蘭氏染色陰性，在含鹽的培養基上，生長繁殖良好，故本菌廣泛存在於海產品及物鹽醃製的肉類、蛋類和感菜中。中毒後主要病變在胃粘膜、空腸及迴腸，表現為急性胃腸炎。
(3)變形桿菌，為革蘭氏染色陰性桿菌，廣泛存在於正常人的腸道、糞便及食品中。本菌在食物中能產生腸毒素，其些變形桿菌能使蛋白質中的組胺酸脫羧而成為組胺，從而引起胃腸道過敏反應。
(4)大腸桿菌及副大腸桿菌：革蘭氏染色陰性桿菌，在正常人腸道內均有存在。一般情況下不致病，但在進食本類細菌汙染的食物，而細菌及其毒素甚多時，可以致病。
(5)金黃色葡萄球菌(簡稱金葡菌)：革蘭氏染色陽性球菌，常存在於正常人的皮膚、鼻腔、咽喉部和皮膚病人的感染化膿病灶中，此菌主要汙染澱粉類食物、乳製品、蛋類和肉類。食物中毒主要由血漿凝固酶陽性的金葡菌所產生腸毒素引起。該毒素對熱的低抗力極強，加熱者沸30分鐘仍保持其毒性。
