西地那非口服後吸收迅速，絕對生物利用度約40%。其藥代動力學參數在推薦劑量範圍內與劑量成比例。消除以肝臟代謝為主(細胞色素P450同功酶3A4途徑)，生成一有活性的代謝產物，其性質與西地那非近似，細胞色素P450同功酶3A4(CYP4503A4)的強效抑制劑(如紅黴素、酮康唑、伊曲康唑)以及細胞色素P450(CYP450)的非特異性抑制物如西咪替丁與西地那非合用時，可能會導致西地那非血漿水平升高。西地那非及其代謝產物的消除半衰期約 4小時。空腹狀態給予25～100mg時，約1小時內達最大血漿濃度(Cmax)127～560ng/ml。西地那非或它的主要代謝產物N-去甲基代謝產物(N-desmethyl)對PDE5選擇性強度約為50%，蛋白結合率為96%。在總西地那非最大血漿濃度時，遊離西地那非Cmax是 22ng/ml。口服或靜脈給藥後，西地那非主要以代謝產物的形式從糞便中排洩(約為口服劑量的80%)，一小部分從尿中排洩(約為口服劑量的13%)。
特殊人群的藥代動力學。
(1)老年人：健康老年志願者(≥65歲)的西地那非清除率降低，遊離血藥濃度比年青健康志願者(18～45歲)約高40%。
(2)腎功能不全者：有輕度(肌酐清除率等於50～80ml/分)和中度(肌酐清除率等於30～49ml/分)腎損害的志願受試者，單劑口服西地那非50mg的藥代動力學沒有改變。重度腎損害(肌酐清除率等於≤30ml/分)的志願受試者，西地那非的清除率降低，與無腎臟受損的同年齡組志願者相比，藥時曲線下面積(AUC)和Cmax幾乎加倍。
(3)肝功能不全者：肝硬變(Child-Pugh 分級A級和B級)志願受試者的西地那非清除率降低，與同年齡組無肝損害的志願者相比，AUC和Cmax分別增高84%和47%。
因此，年齡65歲以上、肝功能損害、重度腎功能損害會導致血漿西地那非水平升高。這類患者的起始劑量以25mg為宜。
