1、橋本甲亢
患者伴發甲亢，部分病例還可有浸潤性突眼、粘液性水腫等。可有典型的甲亢表現。這類患者甲亢狀態可持續數年，常需要抗甲狀腺藥物治療，或採用中醫“和”法治療，以免發展成甲減。手術切除或放射性核素治療均不適宜，易發生永久性甲減。
2、假性甲亢
少數患者可有甲亢的臨床表現，如心悸、多汗、神經過敏等，但甲狀腺功能檢查無甲亢證據，TGAb、TMAb陽性。這種病人無需抗甲狀腺藥物治療，症狀可自行消失。
3、突眼型
本病可發生浸潤性突眼，其甲狀腺功能可正常、亢進或減退。眶後肌有淋巴細胞浸潤、水腫。血清TGAb和TMAb均為陽性。
4、類亞急性甲狀腺炎型
少數患者發病較急，伴發熱，甲狀腺迅速增大，伴局部疼痛和壓痛，血沉加快，但攝碘率正常或增高，甲狀腺抗體高滴度限性。
5、青少年型
青少年甲狀腺腫中，橋本甲狀腺炎約佔40%，其甲狀腺較小，甲狀腺功能正常，甲狀腺抗體滴度又較低，臨床診斷較困難。有部分患者甲狀腺腫增大較迅速，稱青少年增生型。部分患者可合併甲狀腺功能減退。
6、纖維化型
病程較長的患者，可出現甲狀腺廣泛纖維化。表現為甲狀腺萎縮、甲狀腺功能減退，部分患者纖維化不均勻，出現一部分或一葉緻密纖維化病變。局部質控堅硬，其餘部分為典型淋巴細胞浸潤，易誤診為腫瘤。
7、伴甲狀腺腺瘤或癌
常表現為孤立性結節，結節部為腺瘤或癌的病理改變，其餘部分為橋本甲狀腺炎的組織學變化。
8、伴發其他自身免疫性疾病
可表現為自身免疫性多發性內分泌病。臨床上可有甲減伴發艾迪生病、糖尿病、甲狀分腺功能減退、原發性閉經等。也可伴發其他自身免疫病，如惡性貧血、重症肌無力、自身免疫性肝炎、系統性紅斑狼瘡、乾燥綜合徵、類風溼性關節炎、慢性萎縮性胃炎等。
