心尖區舒張期雜音尚可見於以下疾病，應予鑑別。
1.相對性二尖瓣狹窄 相對性二尖瓣狹窄見於重度貧血，甲狀腺功能亢進症，擴張型心肌病，左向右分流的先天性心臟病，以及重度單純二尖瓣關閉不全，這些情況下，舒張期二尖瓣口血流量增大，於心尖區常可聞及舒張期雜音，但該雜音性質較柔和，歷時較短，無舒張期震顫，不伴S1亢進，也無開瓣音。
2.風溼性心瓣膜炎 急性風溼熱發生活動性二尖瓣瓣膜炎時，可出現心尖區舒張期雜音，稱為Carey-Coombs雜音，該雜音為一柔和舒張早期雜音，每天變化較大，比器質性二尖瓣狹窄雜音音調高，此雜音可因風溼性心臟炎痊癒而完全消失。
3. 嚴重主動脈瓣關閉不全 嚴重主動脈瓣關閉不全，二尖瓣前葉在舒張期受到主動脈反流血流的衝擊而上抬，致二尖瓣前葉開放受限，引起相對性狹窄，因此常在心尖區聽到柔和，短促的舒張中期雜音，稱為Austin-Flint雜音，在吸入亞硝酸異戊酯後減弱(二尖瓣狹窄者雜音增強)，該雜音不伴亢進的S1和開瓣音，但有頸動脈搏動增強，以及周圍血管徵等。
4.左心房黏液瘤 左心房黏液瘤可產生類似二尖瓣狹窄的症狀和體徵，但其雜音往往間歇性出現，隨體位而改變，一般無開瓣音：可聞及腫瘤撲落音;極少出現心房顫動，但易反覆發生周圍動脈栓塞，UCG對診斷本病幫助極大，表現為左心房內有一邊緣規整的雲霧樣光團，回聲較均勻，強度中等。
5.縮窄性心包炎 當左側房室溝部位的心包縮窄時，可使左側房室通道變窄，左心房增大，有類似二尖瓣狹窄的表現，但超聲心動圖顯示其瓣膜正常，而相應心包縮窄部位回聲濃密，或兩層心包間出現雜亂回聲。
