母親和胎兒的預後與甲亢病程的控制程度有關。如妊娠前患甲亢、並已控制很好，或妊娠早期發現甲亢進行合理治療，一般母親和嬰兒預後都好。如果直到妊娠中期，母親仍處於甲亢，母親和胎兒或新生兒的併發症明顯增加。
母親的併發症：最主要的是甲狀腺危象一旦發生其死亡率可高達25%。危象常發生在某些應激狀態如分娩、手術(剖宮產)、感染等以後，發病常見於分娩或手術後數小時。臨床症狀可見高熱(>40℃)，與體溫不成比例的心動過速，也可發生房顫其他症狀可有嘔吐、腹痛、腹瀉、脫水、以及中樞神經系統方面症狀如不安抽搐，以至昏迷。出現貧血、妊高徵、胎盤早剝、甲亢危象、間斷感染、I型糖尿病等。
胎兒及新生兒的併發症：早產兒、死胎、死產、畸形、胎兒生長受限(FGR)、小於胎齡兒(SGA)、胎兒窘迫、新後兒室息，胎兒和/或新生兒甲亢等。
