顱咽管瘤是一種好發於鞍區的先天性腫瘤，腫瘤發生與下丘腦-垂體軸關係密切，因此臨床上顱咽管瘤患者常常伴有下丘腦、垂體功能受損的症狀和體徵，進而影響患者內分泌情況，在兒童多表現為生長髮育遲緩，青春期發育延遲、停止或不發育；在成人常見的內分泌功能紊亂是性腺激素低下，表現為男性陽萎，女性月經紊亂、停經等。手術全切腫瘤是目前治療顱咽管瘤首選方法，手術會進一步影響垂體及下丘腦功能，加劇患者內分泌紊亂，嚴重可能會危及生命。
大部分患者手術前都存在一種或幾種激素的不同程度的低下（除PRL），並且術後較術前情況進一步加重，在術後早期恢復不明顯。甲狀腺功能低下是顱咽管瘤較常見的內分泌症狀，常表現為怕冷，精神食慾差，皮膚乾燥，心動過緩等，但由於甲狀腺激素在體內代謝週期長，往往手術近期的影響不明顯，而TSH受手術影響顯著。顱咽管瘤術後出現皮質醇水平低下的發生率可達24-91％ ,有作者報道經蝶手術術後皮質醇低下發生率為37％，開顱術後發生率為61％，完善的皮質醇激素替代治療可以明顯減低圍手術期出現皮質醇水平低下的發生率。性腺激素低下是成人顱咽管瘤最常見的表現，但也是最容易被忽視的方面，尤其是在成年男性患者，但毫無疑問的是，性激素的低下對患者帶來的危害是巨大的，尤其是兒童及青少年，造成青春期發育遲滯，甚至不發育，對年輕女性則可能造成月經紊亂，卵巢子宮的發育障礙，不孕不育等嚴重後果。8-50％的患者可出現血清泌乳素升高，表明下丘腦受侵或顱咽管瘤影響下丘腦到垂體門脈血管的多巴胺運輸。
尿崩是顱咽管瘤的特徵性臨床症狀之一，由於腫瘤影響了下丘腦ADH的產生或運輸，導致了腎遠曲小管及集合管無法對水分進行重吸收，造成大量低滲尿排出。手術對尿崩的影響非常明顯，由於顱咽管瘤大多起源與垂體柄關係密切，術中對垂體柄的騷擾或損傷都可以加劇術後尿崩的情況。
手術方式和腫瘤切除的程度對於術後內分泌的變化有明顯影響。有人比較了開顱和經蝶兩種手術方式對術後內分泌水平的影響情況，結果顯示開顱術後出現垂體功能低下及尿崩的比例明顯高於經碟手術結果，歸究其原因，開顱手術對垂體柄的保護十分困難，顱咽管瘤大部分與垂體柄關係密切，切除腫瘤過程中很可能損傷甚至切斷垂體柄，勢必引起嚴重的內分泌後果。而經蝶手術可以早期對垂體前葉進行保護，使得術後垂體前葉功能受損程度減到最小。腫瘤切除的程度也是術後內分泌受損的重要因素，廣泛而徹底切除腫瘤過程中損傷下丘腦-垂體軸的幾率要大的多。
顱咽管瘤內分泌異常在大多數病人是不可逆的，並且術後有進一步加重。腎上腺皮質、甲狀腺功能、性腺功能低下嚴重影響術後恢復及正常生活，甚至危及生命，因此激素替代治療應該作為顱咽管瘤治療的重要部分。我們的經驗是顱咽管瘤患者術前應進行全面的內分泌評價，所有患者術前3天開始口服強的松15mg/d（術前內分泌檢查顯示腎上腺皮質功能低下患者可術前3天開始補充氫化考的松100-200mg/d），術中補充氫化考的松100mg，術後三天靜脈補充氫化考的松200-300mg/d，三日後換口服強的松15-20mg/d並逐漸減量，在此過程中需要監測血皮質醇，尿遊離皮質醇等指標，並且觀察患者的臨床症狀，如有高熱、感染、創傷等併發症時，需增加強的松的劑量，可每日靜滴氫化考的松100-300mg，在併發症過後，在數日內遞減至原來維持量。部分患者可能需要終身激素替代治療。甲狀腺功能低下患者可術後使用左旋甲狀腺素，開始50μg/d，在數週內增至100-200μg/d,患者治療後畏寒，精神差，浮腫等症狀緩解。因單用甲狀腺激素可加重腎上腺皮質功能不足，故在用甲狀腺激素之前或至少同時，應優先補充考的松類激素。性激素低下男性患者可使用睪酮，以改善性功能。同時雄激素具促進蛋白質合成作用，使患者的體力和營養狀況好轉。女性病人可作人工週期治療，也可使用小劑量雄激素，以改善性功能，增強體力。
手術是治療顱咽管瘤的首選治療方法，手術全切腫瘤是降低術後復發的最重要因素，一旦復發則再次手術全切率極低，並且術後的致死致殘率明顯升高，因此在保存患者內分泌功能和腫瘤切除之間，全切腫瘤永遠是第一位的考慮。手術過程中應該重視對下丘腦、垂體柄，垂體的保護，避免不必要的牽拉和強行盲目切除。應積極進行內分泌替代治療。
