肩關節是全身最靈活的關節，肩關節的組成解剖複雜。肩關節是由六個關節組成。因為肱骨頭較大，呈球形，關節盂淺而小肩關節僅包繞肱骨頭的1/3，關節囊薄而鬆弛，所以肩關節是人體運動範圍最大而又最靈活的關節，它可做前屈、後伸、內收、外展、內旋、外旋以及環轉等運動。導致肩關節疼痛的具體原因就是上述解剖解構。接下來我將常見導致肩關節疼痛的原因進行歸納總結：
肩峰撞擊徵：由於肩關節退行性變、肩峰下骨贅形成、滑囊增生，導致肩峰下的間隙變小，從而出現外展、上舉手臂時造成肩袖擠壓、撞擊而產生的肩關節疼痛。任何年齡均可發生，以中老年人居多。在現實生活中，該類疾病是導致肩關節疼痛的最常見原因。一般來說，這個疾病才是導致日常肩關節疼痛的元兇。
鈣化性肌腱炎：鈣鹽沉著於肌腱中，最常見於肩關節的肩袖肌腱，引起鈣鹽沉著的原因目前尚不清楚，可能與肌腱退變、缺血缺氧、局部壓力增高等因素有關。該類疾病導致的疼痛時常會出現夜間疼醒的情況。
喙突撞擊徵：由於各種原因：如退變、骨質增生、先天性解剖異常導致喙突與肩關節之間的解剖間隙變窄，喙突與肩關節在外展內旋位時會發生撞擊，然後導致疼痛。
肩鎖關節分離：通常是外傷導致肩鎖關節之間的韌帶損傷，肩鎖關節出現脫位和分離，肩關節活動出現障礙及疼痛。
肩關節不穩：各種原因導致肩關節的穩定性出現狀況，最常見的是以往有過肩關節脫位的病史，當時處理肩關節脫位的時候不規範或者患者由於有精神類疾病欠配合，容易導致肩關節不穩，而後在日常生活中反覆出現前脫位、後脫位、下脫位等等，該類疾病導致的肩關節疼痛是非常劇烈且合併有活動障礙。
肩袖損傷：是指圍繞肱骨頭肩袖組織的撕裂損傷，主要病因是肩峰撞擊徵。長期的肩峰撞擊症導致肩袖變性，肌腱質量下降，最終發生損傷撕裂。
肩關節盂唇損傷：肩關節盂邊緣上起加深關節盂作用的那個纖維軟骨盤，或者叫"肩窩的邊緣"。肩關節盂唇的撕裂可以發生於人體墜地時上臂直接著地，或上臂直接打擊而發生的肱骨異常運動。大結節和肩袖對後部盂唇反覆撞擊亦可造成損傷，這種情況叫內部撞擊(軟組織的擠壓)，常見於羽毛球、棒球、網球等手臂常處於過頂(overhead)姿勢的運動員。還可發生於用力提拉動作、反覆投擲運動。通常最常見的肩關節盂唇損傷是發生於盂唇頂端，前後延伸的撕裂，叫SLAP撕裂。
肱二頭肌長頭肌腱炎：由於反覆的體力勞作導致肱二頭肌長頭肌腱磨損而引起肌腱腱鞘充血、水腫等炎症性改變。好發於中年人，主要表現為肩部疼痛，但無肩關節外旋等方向的活動受限。
凍結肩：一類引起盂肱關節僵硬的粘連性關節囊炎，以肩關節周圍疼痛及各個方向活動受限為主要特徵的臨床綜合徵。主要好發於 50 歲左右的中老年人，過去統稱為“肩周炎”。
肩關節感染：如：結核、各種細菌感染。該類情況會由於感染的具體因素而導致疼痛有其特殊性。
膽囊類疾病導致的肩關節疼痛：部分膽囊病變會出現右肩胛下區放射疼，該類疾病容易導致誤認為是肩關節類疾病導致的疼痛。
心臟類疾病導致的肩關節疼痛：部分心梗患者會出現左側肩關節放射性疼痛。
肩關節骨性關節炎：由於各種原因導致肩關節軟骨損傷，盂肱關節會出現疼痛間隙變窄。
風溼免疫類肩關節疾病：各種全身性風溼免疫類疾病會出現肩關節滑膜類病變，導致肩關節疼痛。
頸椎病變導致的肩關節疼痛：各類頸椎疾病如頸椎病、頸椎結核、頸椎腫瘤會出現相應的肩關節疼痛，上肢感覺異常上肢無力的情況。
對於一個肩關節疼痛的患者一般來說是需要通過仔細詢問病史、進行肩關節常規照片和特殊體位的照片並結合專業的手法體格檢查(有幾十種，該類檢查只有經過專業培訓的關節外科醫師才擁有這方面的專業技能)來進行初步的判斷，必要時一定要進行肩關節的核磁共振檢查，千萬不要給患者貿然下一個肩周炎的結論。
根據國內外統計數字，真正的“凍結肩”(既往稱為：肩周炎)佔肩關節疼的比例很少，肩關節疼痛最常見的疾病是肩峰撞擊症和肩袖損傷。
