肛瘻是直腸、肛管與周圍皮膚組織發生變性相通的一類疾病，臨床以肛旁腫塊反覆痛脹溢膿為特徵，經久不愈。肛瘻一旦形成，自然癒合的可能性很小，即使外口閉合病情穩定也是暫時的，待機體抵抗力下降仍會出現急性發病。手術是肛瘻患者的唯一選擇。
中醫對肛瘻手術的最大貢獻是應用掛線療法治療高位肛瘻，減少了肛管括約肌的損傷，有效地避免了肛瘻術後各種併發症的發生。目前的肛瘻手術方法可分為兩種：即切斷括約肌和保留括約肌的手術方法，切斷括約肌的手術方法以傳統的經典肛瘻切開術為代表，為臨床常用的基本術式。但其僅適於低位單純性肛瘻；保留括約肌的手術方法的核心是切除原發病灶及瘻道而不切斷肛門括約肌。這類術式由於保留了肛門括約肌，故而肛門的功能得到了良好的保護，而且損傷小，療程短，但若內口封閉不當，仍然存在病灶清理不徹底等復發的可能。
近年來，中醫針對保留括約肌的肛瘻手術方法有了深入的研究和長足的發展，如針對多竇道高位複雜性肛瘻採用同期多側掛線通過控制掛線的鬆緊，來控制脫線時間，從而達到同期手術、分期脫線、一次治癒的目的；針對多支管複雜性肛瘻採用線管拖線引流來治療，通過合理清除內口，主管開放、支管拖線引流，不必全部切除瘻管，避免了手術過多損傷肛周組織，達到了保護肛門的目的。中醫還認為，手術是肛瘻治癒的第一要素，術後換藥則是肛瘻治癒的第二要素，合理的術後換藥有利於促進創面癒合，防止創口假性癒合和癒合遲緩乃至復發，術後數十種中藥外用特色藥膏、丹、散劑，應用於術後的不同階段，分別具有清熱涼血、祛腐生肌、散瘀止痛、生肌收口等功效，從而有效地避免了感染、潰瘍、疼痛等情況發生，及時促進創面癒合。
雖然肛瘻的根治問題已得到了較好地解決，對肛門功能的保護也有很大的提高，然而要使肛瘻得以徹底根治，又使肛門的功能得到很好的保護，關鍵在於肛瘻的早日手術，以免病情複雜化，由此更可以減少肛管的組織損傷。平時肛瘻患者應注意養成良好的生活和飲食習慣，增強體質，提高抵抗力配合手術治療從而可以使肛瘻的根治和肛門功能的保護達到最佳水平。
